今日《自然》:搞清了新冠病毒会怎么搞乱细胞通路,其弱点暴露了

▎药明康德内容团队编辑

今日,顶尖学术期刊《自然》在线发表了一篇论文,研究者提取了新冠病毒感染的细胞的蛋白质组,并做了分析。该研究发现,新冠病毒可谓是把细胞通路“搞得一团糟”,影响了包括蛋白翻译、RNA剪接、碳代谢以及核酸代谢等多个方面。但与此同时,科学家们也从中找到了潜在的治疗靶点。

我们知道,在新冠疾病的治疗上,我们能用的疗法还非常有限。一方面,这是因为新药研发的周期长;另一方面,也是因为我们对新冠病毒如何影响细胞的具体机制还不甚了解。在这项研究里,科学家们使用蛋白质组分析的方法,对新冠病毒感染的细胞进行了分析。

具体来看,研究人员们用新冠病毒感染了细胞系,并在不同的时间节点,对其进行了定量的翻译组(translatome)和蛋白组(proteome)的分析。感染的6个小时后,这些细胞的蛋白质组开始出现了变化。而在24个小时后,这些变化变得更为明显:研究人员们发现,有一簇蛋白在感染期间的水平出现了下降,且与胆固醇代谢有关;另一簇蛋白在感染期间,水平出现了上升,而它们与RNA修饰和碳代谢有关。

▲细胞感染新冠病毒24小时后,多条细胞通路的蛋白质水平发生了显著变化(图片来源:参考资料[1])

值得注意的是,在25个剪接体元件中,有14个的水平在新冠病毒感染后出现上升。添加剪接体抑制剂,能够抑制病毒的复制。因此,研究人员们指出RNA的剪接是新冠病毒复制的重要一步,可能是潜在的重要靶点。

研究人员们也评估了碳代谢对于新冠病毒感染的影响。他们使用了一种糖酵解过程中的限速酶抑制剂,也在培养的细胞中抑制了新冠病毒的复制。

值得一提的是,上述使用的两种药物的使用剂量都较低,没有产生毒性。综合这些结果,研究人员们指出剪接体抑制剂和糖酵解抑制剂都有望成为潜在的新冠治疗靶点。

▲了解新冠病毒影响细胞的具体机制,有助于找到新的药物靶点(图片来源:药明康德内容团队制图)

为了找到更多能抑制新冠病毒复制的抑制剂,研究人员们做了进一步的探索,找到了一簇和核酸代谢有关的蛋白质。事实上,常见的抗病毒药物利巴韦林就是一类干扰核酸代谢的药物,因此这个结果并不算太意外。此外,它们还找到了一些和蛋白质稳态有关的蛋白。干扰这些蛋白,同样可以在低浓度下抑制新冠病毒的复制。

总结来看,通过分析新冠病毒感染的细胞的蛋白质组,研究人员们揭示了这种病毒能怎样影响细胞的不同通路。而这些结果,也为我们找到新冠药物的新靶点提供了洞见。

参考资料:

[1] Bojkova, D., Klann, K., Koch, B. et al. Proteomics of SARS-CoV-2-infected host cells reveals therapy targets. Nature (2020). https://doi.org/10.1038/s41586-020-2332-7

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