鸡鸣寺位于南京市玄武区鸡笼山东麓山阜上，又称古鸡鸣寺，始建于西晋，是南京最古老的梵刹之一，自古有“南朝第一寺”，“南朝四百八十寺”之首寺的美誉，是南朝时期中国的佛教中心。
鸡鸣寺历史可追溯至东吴的栖玄寺，寺址所在为三国时属吴国后苑之地，300年（西晋永康元年）在此倚山造室，始创道场。东晋以后，此处被辟为廷尉署，至527年（南朝梁普通八年）梁武帝在鸡鸣埭兴建同泰寺，使这里从此真正成为佛教胜地。
1387年（明朝洪武二十年）明太祖朱元璋下令拆去旧屋，扩大规模，重建寺院。朱元璋题额为“鸡鸣寺”。后经明宣德、成化、弘治年间扩建，院落规模宏大，占地达百余亩。后来古寺毁于咸丰战火，虽同治年间重修，规模已大大缩小，但香火却一直旺盛不衰。
1958年改为尼众道场。1983年起，在原住持宗诚法师的带领下，依明清时规模形制，鸡鸣寺逐步恢复并对外开放，成为南京一重要寺院。1992年，《新白娘子传奇》剧组因当时西湖的雷峰塔已倒而新的尚未修建好，来到南京古鸡鸣寺借用药师佛塔来拍雷峰塔相关剧目。
南朝梁，梁武帝经常到寺里讲经说法，听众逾万，并曾先后四次到同泰寺舍身为僧，脱下皇帝龙冠蟒袍，穿上僧衣，在寺中过起僧人生活，人称为“皇帝菩萨”。由于皇帝的尊崇，同泰寺俨然如当时南方之佛教中心，天竺高僧菩提达摩从印度来建康时，就居于此。同泰寺与台城（宫城）隔路相对，整个寺院依皇家规制而建，规模宏大，金碧辉煌，盛极一时，无愧于“南朝四百八十寺”首刹之誉。
鸡鸣寺山门位于鸡鸣寺路左侧石级上，山门正中书写“古鸡鸣寺’四个金字，步入山门，左为施食台（志公台）。施食台前为弥勒殿，其上为大雄宝殿和观音楼，殿内供奉着两尊由泰国赠送的释迦牟尼和观音镏金铜坐像，并新塑了观音应身像三十二尊，供奉于殿内。
大雄宝殿之东为凭虚阁遗址，西为塔院。塔院内全部采用青石磨光雕花工艺，青石铺设地面，药师佛塔为1990年重新建造，观音楼左侧为豁蒙楼，楼甚轩敞。豁蒙楼东即为景阳楼，楼上有对联一副云：“鸡笼山下，帝子台城，振起景阳楼故址；玄武湖边，胭脂古井，依然同泰寺旧观。”这副对联包含着关于鸡笼山、台城、玄武湖、同泰寺和胭脂古井等遗迹的故事。这两座名楼为供人凭栏远眺之处，今已分别辟为茶座和素餐馆，一面临窗。
鸡鸣寺内现有大雄宝殿、观音楼、韦驮殿、志公墓、藏经楼、念佛堂、药师佛塔、胭脂井、豁蒙楼、景阳楼等主要建筑。大雄宝殿内奉祀三宝佛，外山门、三大士阁、钟鼓楼、禅房、素菜馆等建筑占地面积约5万平方米。山门牌坊“鸡鸣寺”由著名书法家、前中国佛协会长赵朴初所题，并有释定持、朱帆、余藻华等名家题撰的楹联墨宝。